This must be hidden
При поддержке препарата АФАЛАЗА

Экспрессионное профилирование ОНП с риском развития рака простаты на 11q13.5 идентифицирует DGAT2 в качестве нового целевого гена

23.09.2016
10
0

В общей сложности девять некодирующих вариантов на 11q13.5 являются предрасполагающими к раку простаты у людей (ПРПЖ).  rs200331695  интрона EMSY связан с агрессивным ПРПЖ и две высококоррелирующие неравновесные по сцеплению (LD) группы однонуклеотидных полиморфизмов (ОНП) в межгенном регионе связаны с высокой летальностью. Исследовался цис-транс-эффект генной экспрессии ОНП с помощью количественного анализа экспрессии локусов. Регулирующий потенциал исследовался в опухолях простаты (n = 41) и в цельной крови (п = 99). Результаты были подтверждены во втором наборе образований простаты (п = 41), на лимфобластоидных клеточных линиях (LCLS) (п = 38), и с помощью Gtex портала. Эффекты гаплотипов были проанализированы в цельной крови. 

В группах ОНП с выраженным LD (rs143975731, rs12277366, rs2155225 и rs2155222) были выявлены связи с экспрессией DGAT2 в обоих наборах опухолей (скрининг P = 0.035-0.043; проверка P = 0.005-0.018). В ПРПЖ с высокой летальностью экспрессия связанных аллелей ниже в два раза. rs200331695 снижало экспрессию DGAT2 на культуре LCLS (P = 0,006). 

Результаты ОНП , регулирующих CAPN5 (P = 0.026-0.046) и AP001189.4 (P = 0.03-0.039) в цельной крови не наблюдалось на LCLS, но ассоциация с экспрессией AP001189.4 была подтверждена с помощью Gtex Portal (P = 8,7 × 10 (-5) до 4,3 × 10 (-4)), что говорит о том , что выраженные межгенные ОНП с LD оказывают тканевой зависимый эффект на экспрессию двух генов . Гаплотипы, включая риск ОНП на 11q13.5 не были связаны с генной экспрессией и ПРПЖ. Полученные данные свидетельствуют о функциональности предрасполагающих к летальности полиморфизмов ПРПЖ rs143975731, rs12277366, rs2155225 и rs2155222 как регуляторов DGAT2 в опухолях простаты. 

Тематики и теги

Комментарии