Секвенирование ДНК одиночных клеток демонстрирует, что варианты ARID1A, GPRC5A и MLL2 регулируют самообновление стволовых клеток рака мочевого пузыря человека
06.10.2017
340
0

Резюме

Раковые стволовые клетки считаются ответственными за многие важные аспекты поведения опухолей, такие как самообновление, инициация роста, резистентность к препаратам и метастазирование. Однако, генетическая основа и происхождение стволовых клеток рака мочевого пузыря человека (СКРМП) остаются неизвестными. Здесь мы провели секвенирование ДНК одиночных клеток из 59 клеток, включающих СКРМПЧ, нестволовые клетки рака мочевого пузыря (НСКРМП), эпителиальные стволовые клетки мочевого пузыря (ЭСКМП) и эпителиальные нестволовые клетки мочевого пузыря (ЭНСКМП) из трёх тканевых образцов рака мочевого пузыря (РМП). В частности, СКРМП демонстрируют клональную гомогенность и филогенетический анализ предполагает их происхождение из ЭСКМП или НСКРМП. Более того, в СКРМП было идентифицировано 21 ключевых изменённых генов, включая шесть генов, ранее не описанных при РМП (ETS1, GPRC5A, MKL1, PAWR, PITX2 и RGS9BP). Ко-мутации ARID1A, GPRC5A и MLL2 через CRISPR/Cas9 значительно усиливают способность СКРМП к самообновлению и инициации роста опухоли. Насколько нам известно, наше исследование впервые даёт обзор генетических основ человеческих СКРМП с помощью секвенирования ДНК одиночных клеток и демонстрирует биклональное происхождение человеческих СКРМП через эволюционный анализ.

Ключевые слова: рак мочевого пузыря, стволовые клетки рака мочевого пузыря, генетическая альтерация, самообновление, секвенирование ДНК из одиночных клеток, эволюция опухоли.

Single-cell Sequencing Reveals Variants in ARID1A, GPRC5A and MLL2 Driving Self-renewal of Human Bladder Cancer Stem Cells

By: Zhao Yang, Chong Li, Zusen Fan, Hongjie Liu, Xiaolong Zhang, Zhiming Cai, Liqin Xu, Jian Luo, Yi Huang, Luyun He, Chunxiao Liu, Song Wu

  • a CAS Key Laboratory of Infection and Immunity, CAS Center for Excellence in Biomacromolecules, Institute of Biophysics, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China;
  • b BGI Education Centre, University of Chinese Academy of Sciences, Shenzhen 518083, China;
  • c College of Life Science, University of Chinese Academy of Sciences College, Beijing 100049, China; dDepartment of Urological Surgery, The Affiliated Luohu Hospital of Shenzhen University, Shenzhen University, Shenzhen 518000, China;
  • e Department of Urological Surgery, Shenzhen Second People’s Hospital, The First Affiliated Hospital of Shenzhen University, Shenzhen 518000, China;
  • f BGI-Shenzhen, Shenzhen 518000, China; 
  • g Department of Urology, Zhujiang Hospital of Southern Medical University, Guangzhou 510000, China

European Urology, Volume 71 Issue 1, January 2017, Pages 8–12

Keywords: bladder cancer, bladder cancer stem cells, genetic alteration, self-renewal, single-cell sequencing, tumor evolution

Автор перевода: Шатылко Тарас Валерьевич

Комментарии

European Urology (Европейская Урология) 2017, Январь;
European Urology (Европейская Урология) 2017, Январь;
Выпуски