Геномное исследование E.coli, взятой из мочевого пузыря женщин с СНМП и без них

21.10.2020
804
0

Американские ученые, рассмотрев геномы кишечной палочки и состав всего уробиома, обнаружили, что наличие, численность и геномный состав являются слабыми предикторами статуса ИМП. Также они предположили, что симптомы ИМП, связанные с обнаружением E. coli, могут быть следствием состава уробиома.

Инфекции мочевыводящих путей (ИМП) поражают около 150 миллионов человек в год. Хотя известно, что ИМП вызывают несколько различных видов бактерий, наиболее частой причиной является уропатогенная кишечная палочка (UPEC). При этом предыдущие исследования показывают, что ИМП могут быть результатом колонизации мочевыводящих путей штаммами E.coli из кишечника, резервуаром которых он является.

К сожалению, нынешняя парадигма ИМП не учитывает уробиом человека. Микробиота мочевого пузыря женщин без симптомов нижних мочевых путей (СНМП) часто включает представителей родов Lactobacillus, Corynebacterium, Gardnerella, Staphylococcus и Streptococcus. Традиционно считалось, что распространение кишечной палочки в мочевыводящих путях может происходить только при наличии инфекции и симптомов, но открытие уробиома и выделение кишечной палочки у бессимптомных людей указывает на иное. Более того, было показано, что естественная микробиота мочевого пузыря отличается от желудочно-кишечного тракта. Таким образом, ИМП не всегда может быть следствием инвазии уропатогена; вместо этого мочевыводящие пути сами могут быть источником штаммов UPEC.

Чтобы выявить факторы, различающие штаммы кишечной палочки, связанные с симптомами пациентов, ученые из США секвенировали геномы 66 изолятов E. сoli из мочевого пузыря взрослых женщин. Пациентки были разделены на 4 группы: (1) без СНМП, (2) с симптомами гиперактивного мочевого пузыря, (3) с ургентным недержанием мочи и (4) с клиническим диагнозом ИМП. Были проведены сравнительные геномные анализы, анализ генов вирулентности и подвижности, а также прогнозирование и тестирование антибиотикорезистенстности.

Результаты исследования показали, что геномное содержание этих изолятов E. coli не соответствует статусу симптомов участника. Cпособность E. coli доминировать и вызывать симптомы не может быть связана с геном или набором генов. Хотя ИМП может быть результатом колонизации E. coli, вполне вероятно, что симптомы ИМП могут быть вызваны несколькими различными бактериями. Это говорит о том, что другие составляющие уробиома могут прямо или косвенно способствовать развитию симптомов ИМП.

Источник: A. Garretto et al., “Genomic Survey of E. coli From the Bladders of Women With and Without Lower Urinary Tract Symptoms,” Front. Microbiol., vol. 11, Sep. 2020, doi: 10.3389/fmicb.2020.02094.

Еще материалы

Комментарии

Еще материалы
Новости по теме