Геномная характеризация почечноклеточного рака с саркоматоидной дедиффренциацией демонстрирует характерные альтерации генома

17.05.2017
1711
0

Актуальность

Геномные характеристики, лежащие в основе почечноклеточного рака с саркоматоидной дедифференциацией (сПКР), не понятны до конца, и в настоящее время нет специфических или эффективных видов терапии сПКР.

Цель исследования

Идентифицировать альтерации генома у пациентов с сПКР.

Дизайн, условия и участники исследования

Мы провели геномное профилирование в парных эпителиальных и саркоматоидных зонах трёх случаев сПКР. Геномное профилирование выполнялось также ещё у 23 пациентов с сПКР, имеющих разнообразные эпителиальные компоненты (всего 26 случаев). Геномное профилирование выполнялось с помощью тест системы для секвенирования ДНК нового поколения; выполнялся гибридный захват ДНК, изучались 236 связанных с развитием рака генов и 19 генов, часто являющихся перестроенными при раке. Результаты сравнивались с 56  прошедшими такое же секвенирование случаями светлоклеточного ПКР (скПКР), лишённого саркоматоидного компонента, а также записями из базы данных The Cancer Genome Atlas по светлоклеточному, папиллярному и хромофобному почечноклеточному раку. Четыре дополнительных случая скПКР подверглись полному секвенированию экзома.

Определение результатов и статистический анализ

Были описаны геномные альтерации у пациентов с сПКР и скПКР, а их частота сравнивалась с помощью точного теста Фишера.

Результаты и ограничения

Два из трёх пациентов с сПКР, подвергшихся геномному профилированию эпителиального и саркоматоидного компонентов, продемонстрировали идентичные профили мутаций, а в третьем случае были выявлены часто встречающиеся генные нарушения. Среди 26 случаев сПКР самыми частыми поражёнными генами были TP53 (42.3%), VHL (34.6%), CDKN2A (26.9%) и NF2 (19.2%). Мутации NF2 были взаимоисключающими с TP53, но не с мутациями VHL. Ограничения исследования включают в себя малый объём выборки.

Заключение

Мы обнаружили, что сПКР имеет драйверные мутации, отличные от скПКР. Эпителиальные и саркоматоидные компоненты сПКР содержат в основном одни и те же геномные признаки. В зависимости от наличия мутаций TP53 или NF2, сПКР можно разделить на две группы. Эти результаты могут повлиять на понимание онкогенеза саркоматоидных опухолей почки и определения вариантов системной терапии.

Ключевые слова: саркоматоидный, почечноклеточный рак, геномный, секвенирование, профилирование, p53.

Genomic Characterization of Renal Cell Carcinoma with Sarcomatoid Dedifferentiation Pinpoints Recurrent Genomic Alterations

Gabriel G. Malouf, Siraj M. Ali, Kai Wang, Sohail Balasubramanian, Jeffrey S. Ross, Vincent A. Miller, Philip J. Stephens, David Khayat, Sumanta K. Pal, Xiaoping Su, Kanishka Sircar, Pheroze Tamboli, Eric Jonasch, Nizar M. Tannir, Christopher G. Wood, Jose A. Karam

European Urology, August 2016, Volume 70, Issue 2, Pages 348–357

Keywords: Sarcomatoid, Renal cell carcinoma, Genomic, Sequencing, Profiling, p53

Автор перевода: Шатылко Тарас Валерьевич

Тематики и теги

Комментарии

Журнал "Европейская Урология"
European Urology (Европейская Урология) 2016 Август
Выпуски
Последние статьи
Роль контрольной биопсии без обнаружения рака как прогностического маркера для реклассификации: результаты исследования Canary Prostate Active Surveillance Study
17.06.2018
198
0
Рецидивирующая инфекция нижних мочевых путей вирусной этиологии
16.06.2018
246
0
Противораковая активность и переносимость терапии, назначаемой после прогрессирования у мужчин, которым исходно проводилась андроген-депривационная терапия с доцетакселом или без него по поводу метастатического кастрационно-наивного рака простаты в исслед
16.06.2018
103
0
Клинические исходы у пациентов с раком простаты с герминальными мутациями генов, ответственных за репарацию ДНК: ретроспективный анализ данных международного исследования
15.06.2018
111
0
Интеграция третичного паттерна Глисона 5 в количественную градацию при в биоптатах простаты и препаратах, полученных при простатэктомии
14.06.2018
149
0