Геномная характеризация почечноклеточного рака с саркоматоидной дедиффренциацией демонстрирует характерные альтерации генома

17.05.2017
1112
0

Актуальность

Геномные характеристики, лежащие в основе почечноклеточного рака с саркоматоидной дедифференциацией (сПКР), не понятны до конца, и в настоящее время нет специфических или эффективных видов терапии сПКР.

Цель исследования

Идентифицировать альтерации генома у пациентов с сПКР.

Дизайн, условия и участники исследования

Мы провели геномное профилирование в парных эпителиальных и саркоматоидных зонах трёх случаев сПКР. Геномное профилирование выполнялось также ещё у 23 пациентов с сПКР, имеющих разнообразные эпителиальные компоненты (всего 26 случаев). Геномное профилирование выполнялось с помощью тест системы для секвенирования ДНК нового поколения; выполнялся гибридный захват ДНК, изучались 236 связанных с развитием рака генов и 19 генов, часто являющихся перестроенными при раке. Результаты сравнивались с 56  прошедшими такое же секвенирование случаями светлоклеточного ПКР (скПКР), лишённого саркоматоидного компонента, а также записями из базы данных The Cancer Genome Atlas по светлоклеточному, папиллярному и хромофобному почечноклеточному раку. Четыре дополнительных случая скПКР подверглись полному секвенированию экзома.

Определение результатов и статистический анализ

Были описаны геномные альтерации у пациентов с сПКР и скПКР, а их частота сравнивалась с помощью точного теста Фишера.

Результаты и ограничения

Два из трёх пациентов с сПКР, подвергшихся геномному профилированию эпителиального и саркоматоидного компонентов, продемонстрировали идентичные профили мутаций, а в третьем случае были выявлены часто встречающиеся генные нарушения. Среди 26 случаев сПКР самыми частыми поражёнными генами были TP53 (42.3%), VHL (34.6%), CDKN2A (26.9%) и NF2 (19.2%). Мутации NF2 были взаимоисключающими с TP53, но не с мутациями VHL. Ограничения исследования включают в себя малый объём выборки.

Заключение

Мы обнаружили, что сПКР имеет драйверные мутации, отличные от скПКР. Эпителиальные и саркоматоидные компоненты сПКР содержат в основном одни и те же геномные признаки. В зависимости от наличия мутаций TP53 или NF2, сПКР можно разделить на две группы. Эти результаты могут повлиять на понимание онкогенеза саркоматоидных опухолей почки и определения вариантов системной терапии.

Ключевые слова: саркоматоидный, почечноклеточный рак, геномный, секвенирование, профилирование, p53.

Genomic Characterization of Renal Cell Carcinoma with Sarcomatoid Dedifferentiation Pinpoints Recurrent Genomic Alterations

Gabriel G. Malouf, Siraj M. Ali, Kai Wang, Sohail Balasubramanian, Jeffrey S. Ross, Vincent A. Miller, Philip J. Stephens, David Khayat, Sumanta K. Pal, Xiaoping Su, Kanishka Sircar, Pheroze Tamboli, Eric Jonasch, Nizar M. Tannir, Christopher G. Wood, Jose A. Karam

European Urology, August 2016, Volume 70, Issue 2, Pages 348–357

Keywords: Sarcomatoid, Renal cell carcinoma, Genomic, Sequencing, Profiling, p53

Автор перевода: Шатылко Тарас Валерьевич

Тематики и теги

Комментарии

Журнал "Европейская Урология"
Выпуски