Прицельное секвенирование экзома ракового генома у пациентов с раком мочевого пузыря очень высокого риска

07.08.2017
435
0

Резюме

Мы выполнили прицельное секвенирование экзома опухолей 50 пациентов с раком мочевого пузыря стадии pTis–pT4b. Мутации категоризировали по типу, стратифицировали по ранее идентифицированным локусам рака в базах данных «Каталог соматических мутаций при раке» и «Атлас ракового генома», и оценили с помощью анализа биохимических каскадов и графиков сочетанных мутаций. Мы анализировали ассоциации мутаций с получением неоадъювантной химиотерапии, поражением лимфоузлов, развитием метастатического заболевания и выживаемостью. По сравнению с Атласом ракового генома мы нашли более высокие показатели частоты мутаций в генах, кодирующих продукты, участвующие в эпигенетической регуляции и регуляции клеточного цикла. Из числа изученных каскадов наибольшую частоту мутаций демонстрировали PI3K/mTOR и каскад клеточного цикла и репарации ДНК. RB1 и TP53, а также NF1 и PIK3CA часто имели сочетанные мутации. Мы не нашли ассоциации между мутациями конкретных генов и интересующими нас ключевыми клиническими результатами после коррекции на множественность проверок. Анализ фазы открытия соматических мутаций у 50 пациентов с раком мочевого пузыря высокого риска показал новые мутации и паттерны мутаций, которые могут быть полезны для разработки режимов таргетной терапии или новых биомаркеров для пациентов с очень высоким риском метастатического заболевания и смерти.

Ключевые слова: рак мочевого пузыря, соматические мутации, эпигенетика, IKZF1, GOLGA5.

Targeted Exome Sequencing of the Cancer Genome in Patients with Very High-risk Bladder Cancer

By: Thomas Longo, Kathleen F. McGinley, Jennifer A. Freedman, Wiguins Etienne, Yuan Wu, Alexander Sibley, Kouros Owzar, Jeremy Gresham, Christopher Moy, Stephen Szabo, Joel Greshock, Hui Zhou, Yuchen Bai and Brant A. Inman

  • a Division of Urology, Department of Surgery, Duke University, Durham, NC, USA
  • b Division of Oncology, Department of Medicine, Duke University, Durham, NC, USA
  • c Department of Biostatistics and Bioinformatics, Duke University, Durham, NC, USA
  • d Janssen Pharmaceuticals Inc., Raritan, NJ, USA
  • e GlaxoSmithKline, Zebulon, NC, USA
  • f Novartis, Holly Springs, NC, USA

European Urology, Volume 70 Issue 5, November 2016, Pages 714-717

Keywords: Bladder cancer, somatic mutations, epigenetics, IKZF1, GOLGA5.

Автор перевода: Шатылко Тарас Валерьевич

Тематики и теги

Комментарии

Журнал "Европейская Урология"
Выпуски