Validation study of a noninvasive urine test for diagnosis and prognosis assessment of bladder cancer: evidence for improved models
Mengual L1, Ribal MJ2, Lozano JJ3, Ingelmo-Torres M2, Burset M2, Fernández PL4, Alcaraz A2
Источник
1Laboratory and Department of Urology, Hospital Clínic, Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer, Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain. Electronic address: lmengual@clinic.ub.es.
2Laboratory and Department of Urology, Hospital Clínic, Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer, Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain.
3Plataforma de Bioinformática, Centro de Investigación Biomédica en red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas, Hospital Clínic, Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer, Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain.
4Pathology Department, Hospital Clínic, Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer, Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain.
Цель
Мы провели исследование описанного нами ранее теста для обнаружения рака мочевого пузыря, основанного на уровнях экспрессии определенных генов в анализе мочи, с использованием независимой когорты. Мы также оценили возможность создания альтернативных моделей с более высокой общей точностью.
Материалы и методы
Паттерны экспрессии 48 ранее описанных генов, включая 12+2 гена разработанной генетической подписи, были определены при помощи анализа TaqMan® у независимой когорты из 207 пациентов (образцы мочи). Мы собрали вместе все результаты, полученные до настоящего времени (404 образца мочи), и использовали их для поиска новых более перспективных моделей.
Результаты
Наша генетическая подпись из 12+2 генов обладала 80% чувствительностью и 86% специфичностью (площадь под кривой (AUC) 0,914) в отношении дискриминации между раком мочевого пузыря и контрольными образцами мочи. Она обладала 75% чувствительностью и 75% специфичностью (AUC 0,83) для предсказания агрессивности опухоли в валидизационном наборе образцов мочи.
После группировки всех образцов для прогностических целей были разработаны 3 новые генетические сигнатуры, содержащие 2, 5 и 10 генов, и одна из 6 генов. Диагностическая производительность 2, 5, 10 и 12-генных подписей была повторно оценена для объединенного набора образцов мочи (AUC 0,913, 0,941, 0,949 и 0,944, соответственно). Эффективность прогноза агрессивности опухоли также стала лучше для 14 и 6-генных подписей (AUC 0,855 и 0,906, соответственно).
Выводы
Настоящее валидизационное исследование подтверждает высокую точность генетической подписи 12+2 в качестве неинвазивного инструмента диагностики рака мочевого пузыря и оценки его агрессивности. Мы также представляем улучшенные модели с меньшим числом генов, которые нуждаются в дополнительной валидизации.
Ключевые слова: мочевой пузырь, рак, уротелий, экспрессия генов, биомаркеры.
Комментарии