Геномный анализ метилирования CpG-участка при раке мочевого пузыря определил TBX2, TBX3, GATA2 и ZIC4 как рТа-прогностические маркеры

12.08.2012

2316

ИСТОРИЯ: Маркеры метилирования ДНК могут быть полезны как в качестве маркеров прогрессии, так и в качестве мочевых диагностических тестов. ЦЕЛЬ: Определить специфические для рака мочевого пузыря (РМП) метилированные последовательности ДНК для предсказания рТа-специфического прогрессирования и выявления РМП в моче. Дизайн, установки и участники: Геномный анализа метилирования был выполнен на 44 опухолях мочевого пузыря с использованием Agilent 244K Human CpG Island Microarray (Agilent Technologies, Санта-Клара, Калифорния, США). Проверка проводилась с помощью диагностикума Illumina 384-plex (Illumina, Сан-Диего, Калифорния, США) в ретроспективной группе из 77 опухолей. Маркеры для прогрессии были определены в опухолях рTа (n = 24) и ретроспективно валидированы самостоятельной группой из 41 опухоли рТа методом SNaPshot (Applied Biosystems, Foster City, Калифорния, США). Измерения: Процент метилирования в опухолях и моче был использован для определения маркеров выявления, связанных с конечной точкой прогрессирования в мышечно-инвазивное заболевание при помощи модели Каплана-Мейера и многомерного анализа. Результаты и ограничения: В группе проверки, метилирование генов Т-поля 2 (TBX2), T-поля 3 (TBX3), GATA связывающего белка 2 (GATA2) и члена группы Zic 4 (ZIC4) было связано с прогрессированием рТа опухолей в мышечно-инвазивное заболевание (р = 0,003). Метилирование только TBX2 показало чувствительность 100%, специфичность 80%, положительную прогностическую ценность 78% и отрицательную прогностическую ценность в 100%, площадь под кривой для предсказания прогрессии - 0,96 (р <0,0001) . Многофакторный анализ показал, что метилирование TBX3 и GATA2 являются независимыми предикторами прогрессирования по сравнению с клиникопатогистологическими переменными (р = 0,04 и р = 0,03 соответственно). Точность прогноза при добавлении метилирования TBX2, TBX3 и GATA2 в стандарты оценки рисков Европейской организации по исследованию и лечению рака может быть повышена на 23%,. Мы также выявили и валидировали 110 CpG-участков (CGI), дифференциально метилированных между опухолевыми клетками и контролем мочи. Ограничением данного исследования является небольшое число пациентов. ВЫВОДЫ: Мы определили четыре маркера метилирования, которые предсказывают прогрессирование рТа опухоли, тем самым позволяя стратификацию пациентов для персонализированного наблюдения. Кроме того, мы определили CрG-участки, которые делают возможным обнаружение опухолей мочевого пузыря, используя в качестве изучаемого субстрата мочу.

Тематики и теги

Рак мочевого пузыря

Журнал

European Urology (Европейская Урология) 2012 Июнь; 61(6)

Геномный анализ метилирования CpG-участка при раке мочевого пузыря определил TBX2, TBX3, GATA2 и ZIC4 как рТа-прогностические маркеры

Тематики и теги

Журнал

Комментарии