Актуальность
По крайней мере половина пациентов с диагнозом мышечнонеинвазивного рака мочевого пузыря (МНИРМП) переносят рецидив и примерно 15% - прогрессию до мышечноинвазивного или метастатического заболевания. Требуются биомаркеры для наблюдения за заболеванием.
Цель исследования
Разработка тест-систем для наблюдения с использованием геномных вариантов в бесклеточной опухолевой ДНК плазмы и мочи.
Дизайн, условия и участники исследования
Ретроспективное пилотное исследование с включением 377 образцов 12 пациентов с рецидивным или прогрессирующим / метастатическим заболеванием. Применялись три метода секвенирования нового поколения, определялись соматические варианты ДНК в опухолевой ткани, плазме и моче с помощью персонализированных тест-систем с использованием цифровой капельной полимеразной цепной реакции (цкПЦР). Образцы были собраны с 1994 по 2015 гг., с периодом наблюдения до 20 лет.
Определение результатов и статистический анализ
Прогрессирование до мышечноинвазивного или метастатического рака мочевого пузыря; t-тест для данных цкПЦР.
Результаты и ограничения
Мы разработали от одной до шести персонализированных тест-систем на пациента. Пациенты с прогрессирующим заболеванием демонстрировали повышенный уровень опухолевой ДНК в плазме и моче до прогрессии по сравнению с пациентами с рецидивирующим заболеванием (p = 0.032 и 1.3 × 10−6 соответственно). Интересно, что опухолевая ДНК обнаруживалась в плазме и моче пациентов с неинвазивным заболеванием, уже не обнаруживаясь у пациентов, свободных от заболевания. Для каждого пациента наблюдался значительный уровень гетерогенности; это может быть вызвано гетерогенностью опухоли или работы тест-системы.
Заключение
Бесклеточная опухолевая ДНК может быть обнаружена в плазме и моче даже у пациентов с неинвазивным заболеванием, высокий уровень опухолевой ДНК обнаруживается перед прогрессией, особенно в образцах мочи. Персонализированные тест-системы геномных вариантов могут быть полезными для мониторирования заболевания.
Ключевые слова: биомаркер, бесклеточная ДНК, циркулирующая ДНК, капельная цифровая ПЦР, геномный вариант, секвенирование нового поколения, МНИРМП, персонализированный анализ, плазма, моча.
Genomic Alterations in Liquid Biopsies from Patients with Bladder Cancer
By: Karin Birkenkamp-Demtröder, Iver Nordentoft, Emil Christensen, Søren Høyer, Thomas Reinert, Søren Vang, Michael Borre, Mads Agerbæk, Jørgen Bjerggaard Jensen, Torben F. Ørntoft and Lars Dyrskjøt
European Urology, Volume 70 Issue 1, July 2016, Pages 75-82
Keywords: Biomarker, Cell-free DNA, Circulating DNA, Droplet digital PCR, Genomic variant, Next-generation sequencing, NMIBC, Personalised analysis, Plasma, Urine
Автор перевода: Шатылко Тарас Валерьевич
Комментарии