Актуальность
Рак из собирательных трубочек (РСТ) является редким видом почечноклеточного рака (ПКР), происходищим из мозгового слоя почки. Клинические исходы неблагоприятны, а общепринятых рекомендаций по его терапии не существует.
Цель исследования
Определить геномные альтерации (ГА) в серии пациентов с местнораспространённым или метастатическим РСТ, у которых проводилось геномное профилирование на каком-либо этапе на протяжении лечения.
Дизайн, условия и участники исследования
Фиксированные в формалине и парафинированные блоки или стёкла были получены у 17 пациентов с РСТ. Была получена ДНК, выполнено полное геномное профилирование в лаборатории, сертифицированной по Clinical Laboratory Improvement Amendments.
Определение результатов и статистический анализ
Байесовские алгоритмы и алгоритмы локального выравнивания были использованы для выявления замен и инсерций / делеций соответственно. Сравнение с нормальными контрольными образцами было использовано для выявления альтераций количества копий. Клинически релевантные ГА (КРГА) были определены как те, которые можно связать с одобренными или изучаемыми видами таргетной терапии.
Результаты и ограничения
Медиана возраста в когорте составила 53 года (диапазон: 26–73), оценивались 14 первичных опухолей и три метастатических очага. Всего 36 ГА были выявлены в этой серии пациентов, со средним количеством 2.1 ГА на случай. Самые частые ГА наблюдались в NF2 (5/17, 29%), SETD2 (4/17, 24%), SMARCB1 (3/17, 18%) и CDKN2A (2/17, 12%). Девять случаев оценивались на ГА в FH, у двух пациентов была гомозиготная потеря FH. Ограничением было то, что выполнялась прицельная оценка генов, участвующих в патогенезе других видов рака, а поэтому мутации вне этого диапазона исключить было нельзя.
Заключение
Рецидивные КРГА были обнаружены в этой серии случаев РСТ и предполагают возможный положительный эффект от таргетной терапии. В частности, применение ингибиторов mTOR может быть интересным у пациентов с альтерациями NF2. Альтерации FH и SMARCB1 также отмечались взаимоисключающим образом с альтерациями NF2.
Ключевые слова: рак из собирательных трубочек, геномное профилирование, медуллярная карцинома, NF2.
Characterization of Clinical Cases of Collecting Duct Carcinoma of the Kidney Assessed by Comprehensive Genomic Profiling
By: Sumanta K. Pal, Toni K. Choueiri, Kai Wang, Depinder Khaira, Jose A. Karam, Eliezer Van Allen, Norma A. Palma, Mark N. Stein, Adrienne Johnson, Rachel Squillace, Julia A. Elvin, Juliann Chmielecki, Roman Yelensky, Evgeny Yakirevich, Doron Lipson, Douglas I. Lin, Vincent A. Miller, Philip J. Stephens, Siraj M. Ali and Jeffrey S. Ross
European Urology, Volume 70 Issue 3, September 2016, Pages 516-521
Keywords: Collecting duct carcinoma, Genomic profiling, Medullary carcinoma, NF2
Автор перевода: Шатылко Тарас Валерьевич
Комментарии