Резюме
Герминогенные тестикулярные опухоли (ГГТО), самый частый вид рака у молодых мужчин, имеют явную наследуемую основу, которая давно заставляет поднимать вопросы о существовании фоновых значимых генов предрасположенности с высокой пенетрантностью. Чтобы определить вклад редких генных мутаций в наследственный риск ГГТО мы проанализировали данные целого экзома для 919 случаев ГГТО и 1609 контрольных субъектов без рака. Мы сравнили между случаями ГГТО и контрольными субъектами частоты редких (< 1%) и нечастых (1-5%) кодирующих вариантов (1) по отдельности и (2) в совокупности на генном уровне с помощью анализа нагрузки (T1, дизруптивные; T2, все неблагоприятные; и T3, все несинонимичные) с использованием точного теста Фишера с поправкой Бонферрони для пороговых показателей значимости. Ни один отдельный вариант и отдельный ген не демонстрировал значимую ассоциацию с ГГТО после коррекции по поводу множественных сравнений.
В самом крупном исследовании по раку яичка с секвенированием целого экзома, которое опубликовано на данный момент, наши результаты не поддерживают существование значимого гена предрасположенности к ГГТО с высокой пенетрантностью (с отношением вероятности > 10 и частотой аллелей [комбинированной] > 0.01%). Учитывая статистическую мощность, это исследование не может исключить существование генов предрасположенности, ответственных за развитие ГГТО в отдельных семьях, или редких мутаций, которые приводят лишь к умеренному относительному риску. В согласии с результатами исследований по поиску ассоциаций в целом геноме, наши результаты поддерживают идею о том, что наследственная предрасположенность является преимущественно полигенной и подвергается ощутимому влиянию со стороны обычной изменчивости.
Ключевые слова: герминогенные опухоли яичка, секвенирование целого экзома, предрасположенность к раку, наследственность, генетика.
Large-scale Sequencing of Testicular Germ Cell Tumour (TGCT) Cases Excludes Major TGCT Predisposition Gene
By: Kevin Litchfield, Chey Loveday, Max Levy, Darshna Dudakia, Elizabeth Rapley, Jeremie Nsengimana, D. Tim Bishop, Alison Reid, Robert Huddart, Peter Broderick, Richard S. Houlston, Clare Turnbull
European Urology, Volume 73 Issue 6, June 2018, Pages 828–831
Keywords: Testicular germ cell tumour, Whole-exome sequencing, Cancer susceptibility, Heritability, Genetics
Автор перевода: Шатылко Тарас Валерьевич
Комментарии