Актуальность
Длинные некодирующие РНК (lncRNA) являются недавно открытым классом относительно неизученных онкогенных молекул с биологической и клинической значимостью. Недостатки современной системы стратификации пациентов с агрессивным заболеванием в значительной степени мотивируют на систематическую идентификацию lncRNA как клинических предикторов при локализованном раке простаты.
Цель исследования
Идентифицировать РНК-биомаркеры, ассоциированные с агрессивным раком простаты.
Дизайн, условия и участники исследования
Микрочиповый анализ материала радикальной простатэктомии и клинические данные были собраны у 910 пациентов из трёх опубликованных одноцентровых когортных исследований: Mayo Clinic I (N = 545, медиана периода наблюдения - 13.8 лет), Mayo Clinic II (N = 235, медиана периода наблюдения - 6.7 лет) и Thomas Jefferson University (N = 130, медиана периода наблюдения - 9.6 лет).
Определение результатов и статистический анализ
Главной клинической конечной точкой была выживаемость без отдалённых метастазов. Вторичными конечными точками были онкоспецифическая выживаемость и общая выживаемость. Унивариабельная и мультивариабельная регрессия Кокса были использованы для оценки ассоциации между экспрессией lncRNA и этими конечными точками.
Результаты и ограничения
Интегративный анализ показал, что Ассоциированный с раком простаты транскрипт – 14 (Prostate Cancer Associated Transcript-14; PCAT-14) является lncRNA, которая наиболее часто аномально экспрессируется у пациентов с раком простаты. Down-регуляция экспрессии PCAT-14 значимо ассоциирована с суммой Глисона и большей вероятностью метастатического прогрессирования, общей выживаемостью и онкоспецифической смертностью в нескольких независимых наборах данных и при разной этнической принадлежности. Низкая экспрессия PCAT-14 связана с генами, участвующими в биологических процессах, провоцирующих агрессивное течение заболевания. Анализ in vitro подтвердил, что низкая экспрессия PCAT-14 стимулировала миграцию, а его гиперэкспрессия тормозила клеточный рост, миграцию и инвазию.
Заключение
Мы обнаружили, что андроген-регулируемый PCAT-14 бывает гиперэкспрессирован при раке простаты и подавляет инвазивный фенотип, а меньшая экспрессия является значимым прогностическим фактором для нескольких клинических конечных точек, что поддерживает его значимость для прогнозирования метастазирования, которое можно использовать в целях улучшения ведения пациентов.
Ключевые слова: агрессивный рак простаты, геномика, длинные некодирующие РНК, метастазы, PCAT-14, PRCAT-104, транскриптом.
Multi-institutional Analysis Shows that Low PCAT-14 Expression Associates with Poor Outcomes in Prostate Cancer
By: Nicole M. White, Shuang G. Zhao, Jin Zhang, Emily B. Rozycki, Ha X. Dang, Sandra D. McFadden, Abdallah M. Eteleeb, Mohammed Alshalalfa, Ismael A. Vergara, Nicholas Erho, Jeffrey M. Arbeit, Robert Jeffrey Karnes, Robert B. Den, Elai Davicioni, Christopher A. Maher
- а Department of Internal Medicine, Division of Oncology, Washington University School of Medicine, St. Louis, MO, USA;
- b Alvin J. Siteman Cancer Center, Washington University School of Medicine, St. Louis, MO, USA;
- c Department of Radiation Oncology, University of Michigan Medical School, Ann Arbor, MI, USA;
- d Beaumont Hospital–Dearborn, Transitional Year Program, Dearborn, MI, USA;
- e McDonnell Genome Institute, Washington University School of Medicine, St. Louis, MO, USA;
- f GenomeDx Biosciences, Vancouver, BC, Canada;
- g Department of Surgery, Washington University School of Medicine, St. Louis, MO, USA;
- h Department of Urology, Mayo Clinic, Rochester, MN, USA;
- i Department of Radiation Oncology, Thomas Jefferson University, Philadelphia, PA, USA;
- j Department of Biomedical Engineering, Washington University School of Medicine, St. Louis, MO, USA
European Urology, Volume 71 Issue 2, February 2017, Pages 257–266
Keywords: Aggressive prostate cancer, Genomics, Long noncoding RNA, Metastases, PCAT-14, PRCAT-104, Transcriptome
Автор перевода: Шатылко Тарас Валерьевич
Комментарии