Актуальность
Среди мужчин с раком простаты клинически низкого онкологического риска мы ранее задокументировали гетерогенность клинических характеристик и геномных индексов риска.
Цель исследования
Более глубоко изучить фоновую биологию опухолей в этой популяции пациентов с помощью расширенного анализа паттернов экспрессии генов у мужчин с опухолями клинически низкого риска.
Дизайн, условия и участники исследования
Биоптаты простаты от 427 пациентов, которые считались потенциально подходящими для активного наблюдения, подверглись центральному гистологическому пересмотру и профилированию экспрессии целого генома. Эти случаи сравнивались с биоптатами от пациентов с раком более высокого риска и разными клиническими характеристиками из проспективно наполняемого геномного регистра.
Определение результатов и статистический анализ
Средний геномный риск (СГР) определялся по 18 опубликованным прогностическим сигнатурам, а наборы важнейших генов MSigDB анализировались с использованием методов бутстреппинга и кластеринга. Эти наборы оценивались в своей связи с клиническими переменными, гистологическими и биохимическими результатами с использованием мультивариабельного регрессионного анализа.
Результаты и ограничения
Всего 408 (96%) биопсий прошли тест качества РНК. Исходя из квартилей СГР, определённых по многоцентровой серии случаев рака высокого онкологического риска, случаи пациентов с раком низкого риска из Калифорнийского университета в Сан-Франциско (UCSF) были распределены по квартилям следующим образом: 219 (54%), 107 (26%), 61 (15%) и 21 (5%). Бесконтрольный кластеринг-анализ наборов ключевых генов выявил три кластера, которые были обогащены по ранее описанным подтипам: PAM50-люминальный A, люминальный B и базальный. СГР, но не кластеры, был ассоциирован как с гистологическими (отношение вероятностей – 1.34, 95%-ный доверительный интервал [ДИ] 1.14–1.58) и биохимическими результатами (отношение рисков – 1.53, 95% ДИ 1.19–1.93). Эти результаты могут недооценивать внутрипростатическую геномную гетерогенность.
Заключение
Рак простаты с гомогенно низким риском по традиционным характеристикам демонстрирует значительное разнообразие на уровне геномной экспрессии. Молекулярная субстратификация рака простаты низкого онкологического риска даёт лучшее понимание его дивергентной биологии и в будущем может помочь персонализировать рекомендации по лечению.
Ключевые слова: активное наблюдение, рак простаты низкого онкологического риска, геномика, прогноз, биопсия при раке простаты, подтипы, биология опухолей.
The Diverse Genomic Landscape of Clinically Low-risk Prostate Cancer
Matthew R. Cooperberg, Nicholas Erho, June M. Chan, Felix Y. Feng, Nick Fishbane, Shuang G. Zhao, Jeffry P. Simko, Janet E. Cowan, Jonathan Lehrer, Mohammed Alshalalfa, Tyler Kolisnik, Jijumon Chelliserry, Jennifer Margrave, Maria Aranes, Marguerite du Plessis, Christine Buerki, Imelda Tenggara, Elai Davicioni, Peter R. Carroll
European Urology, October 2018, Volume 74, Issue 4, Pages 444–452
Keywords: Active surveillance, Biomarkers, Low-risk prostate cancer, Genomics, Prognosis, Prostate cancer biopsy, Subtyping, Tumor biology
Автор перевода: Шатылко Тарас Валерьевич
Комментарии