Актуальность
Для пациентов со светлоклеточным почечноклеточным раком (скПКР) идентифицирован ряд биомаркеров-кандидатов, но большинство из них не были валидизированы.
Цель исследования
Валидизировать прогностические биомаркеры при скПКР, данные по которым были ранее опубликованы, в независимой когорте пациентов и оценить внутриопухолевую гетерогенность (ВОГ) наиболее многообещающих маркеров чтобы направить процесс оптимизации биомаркерной диагностики.
Дизайн, условия и участники исследования
Онкоспецифическая выживаемость (ОСВ) для каждого из 28 идентифицированных генетических или транскриптомных биомаркеров была оценена у 350 пациентов с скПКР. ВОГ определялась по набору данных мультифокальной биопсии в 10 случаях скПКР.
Определение результатов и статистический анализ
Взаимосвязь экспрессии биомаркеров с ОСВ была проанализирована при унивариабельном и мультивариабельном анализах.
Результаты и ограничения
Всего 17 из 28 биомаркеров (мутации TP53; амплификации хромосом 8q, 12, 20q11.21q13.32 и 20; делеции 4p, 9p, 9p21.3p24.1 и 22q; низкая экспрессия EDNRB и TSPAN7; шесть сигнатур экспрессии генов) были валидизированы как предикторы плохой ОСВ в унивариабельном анализе. Только стадия опухоли и сигнатура экспрессии ccB были независимыми предикторами в мультивариабельном анализе. ВОГ сигнатуры ccB была идентифицирована в 8 из 10 опухолей. В образцах с экспрессией сигнатуры ccB были выражены в большей степени несколько генетических альтераций, которые были значимы при унивариабельном анализе, и были повышены индексы хромосомной нестабильности. Это исследование может быть недостаточно мощным для валидации биомаркеров с низкой встречаемостью.
Заключение
Сигнатура ccB была единственным независимым прогностическим биомаркером. Большая выраженность нескольких генетических альтераций, ассоциированных с плохим прогнозом, в образцах с ccB показала, что несколько клеточных событий могут требоваться для формирования этого агрессивного фенотипа, и в некоторых опухолях этот процесс катализируется хромосомной нестабильностью. Мультифокальная оценка может повысить точность этого биомаркера.
Ключевые слова: биомаркер, внутриопухолевая гетерогенность, рак почки, персонализированная медицина, прогностический маркер.
Systematic Evaluation of the Prognostic Impact and Intratumour Heterogeneity of Clear Cell Renal Cell Carcinoma Biomarkers
By: Sakshi Gulati a , Pierre Martinez b , Tejal Joshi c , Nicolai Juul Birkbak c , Claudio R. Santos b , Andrew J. Rowan b , Lisa Pickering d , Martin Gore d , James Larkin d , Zoltan Szallasi c e , Paul A. Bates a lowast , Charles Swanton b f and Marco Gerlinger b g
European Urology, Volume 66 Issue 5, November 2014, Pages 936-948
Keywords: Biomarker, Intratumour heterogeneity, Kidney cancer, Personalised medicine, Prognostic marker
Автор перевода: Шатылко Тарас Валерьевич
Комментарии