Цель
Иммунологическая среда влияет на прогноз рака. Этот эффект частично зависит от генетического фонда пациента. Цель этой работы оценить взаимосвязь между различными вариантами наличия генов воспаления и прогнозом мышечнонеинвазивного рака мочевого пузыря.
Методы
Проспективно изучено 822 пациента с МНИРМП (538 низкого риска [PUNLMP/Ta BG WHO 2004] и 284 высокого риска [Ta G3, T1 и CIS]) с последующим десятилетним наблюдением. Выявлено 1679 вариантов генотипа из 259 генов, влияющих на процесс воспаления. Для оценки взаимосвязи вариантов генотипа с риском рецидива и прогрессии использовались классические статистические методы (Модель Кокса) и инновационные (Bayesian Lasso [BL] и Bayes A [BA]). Дискриминационная способность моделей оценивалась при помощи индекса конкордантности.
Результаты
Среднее время наблюдения составило 82,7 месяцев (2,5–117,6 месяцев). За этот период развилось 268 рецидивов и 76 прогрессий опухоли. Рецидив: По модели Кокса не выявлено никакой взаимосвязи генотипа с развитием рецидива. Но по методам BL и BA три варианта генов TNIP1, CD5 и JAK показали очень сильную взаимосвязь с риском рецидива (>90%). Прогрессия: Согласно модели Кокса отмечена взаимосвязь CD3G с риском прогрессии (HR=2,69; p=1,55×10−5), а BL и BA отмечают роль еще двух генотипов MASP1 и AIRE (>80%). После внутренней валидации, добавление новых вариантов повысило дискриминационную способность моделей с 58,4% до 60,5% и с 72,1% до 72,8% для риска рецидива и прогрессии, соответственно.
Заключение
Использование инновационных статистических методов позволило выявить взаимосвязь между генами воспаления и прогнозом МНИРМП. Добавление новых вариантов позволило улучшить дискриминационную способность моделей.
Комментарии