Актуальность

Молекулярные подтипы рака предстательной железы (РПЖ) определялись по сути взаимоисключающими характеристиками, включая слияния генов ETS (чаще всего с вовлечением ERG) и гиперэкспрессию SPINKI. Клиническая оценка может помочь в стратификации заболевания, дополняя доступные прогностические тесты.

Цель исследования

Определить аналитическую валидность и клиникоморфологические взаимосвязи выделения молекулярных подтипов на основе микрочипов.

Дизайн, условия и участники исследования

Мы проанализировали профили экспрессии Affymetrix GeneChip для 1577 пациентов после радикальной простатэктомии из восьми когорт, включая 1351 случай, оцененный с помощью прогностических тестов Decipher (GenomeDx Biosciences, Сан Диего, Калифорния, США), проведённых в лаборатории с сертификатом Clinical Laboratory Improvements Amendment. Основанная на микрочипах (m-) классификационная модель ERG по типу «случайного леса» была обучена и валидизирована. Внешний анализ экспрессии был использован для прогнозирования других взаимоисключающих перестроек ETS-генов, не связанных с ERG (ETS+), или гиперэкспрессии SPINKI (SPINKI+).

Определение результатов

Взаимосвязь с клиническими характеристиками и исходами, определённая с помощью мультивариабельного анализа логистической регрессии и кривых рабочей характеристики приёмника (ROC-анализ).

Результаты и ограничения

Классификатор m-ERG продемонстрировал 95%-ную точность в независимой группе валидации (155 образцов). По всем когортам 45% случаев РПЖ были классифицированы как m-ERG+, 9% как m-ETS+, 8% как m-SPINKI+ и 38% как трижды негативные (m-ERG- / m-ETS- / m-SPINKI-). Профилирование экспрессии генов поддерживает выделение трёх подлежащих молекулярно определённых групп: m-ERG+, m-ETS+ и m-SPINKI+ / трижды негативные. При мультивариабельном анализе m-ERG+ опухоли были ассоциированы с меньшим уровнем простат-специфического антигена в сыворотке до операции и меньшей суммой баллов Глисона, но с более частым экстрапростатическим распространением (p < 0.001). Опухоли m-ETS+ были ассоциированы с инвазией в семенные пузырьки (p = 0.01), тогда как опухоли m-SPINKI+ / трижды негативные имели более высокую сумму Глисона и чаще встречались у чернокожих пациентов / пациентов-афроамериканцев (p < 0.001). Клинические исходы не отличались значимым образом при разных подтипах.

Заключение

Клинически доступный прогностический тест (Decipher) может также оценивать молекулярные подтипы РПЖ, устраняя необходимость дополнительного тестирования. Были обнаружены клиникоморфологические различия среди подтипов, выделенных на основе паттернов глобальной экспрессии.

Ключевые слова: рак простаты, ERG, ETS, SPINKI, микрочип, прогноз.

Characterization of 1577 Primary Prostate Cancers Reveals Novel Biological and Clinicopathologic Insights into Molecular Subtypes

By: Scott A. Tomlins a b c d, Mohammed Alshalalfa e , Elai Davicioni e , Nicholas Erho e , Kasra Yousefi e , Shuang Zhao f , Zaid Haddad e , Robert B. Den g , Adam P. Dicker g , Bruce J. Trock h , Angelo M. DeMarzo h , Ashley E. Ross h , Edward M. Schaeffer h , Eric A. Klein i , Cristina Magi-Galluzzi i , R. Jeffrey Karnes j , Robert B. Jenkins k and Felix Y. Feng a d f

• a Michigan Center for Translational Pathology, University of Michigan Medical School, Ann Arbor, MI, USA
• b Department of Pathology, University of Michigan Medical School, Ann Arbor, MI, USA
• c Department of Urology, University of Michigan Medical School, Ann Arbor, MI, USA
• d Comprehensive Cancer Center, University of Michigan Medical School, Ann Arbor, MI, USA
• e GenomeDx Bioscience Inc., Vancouver, British Columbia, Canada
• f Department of Radiation Oncology, University of Michigan Medical School, Ann Arbor, MI, USA
• g Kimmel Cancer Center, Jefferson Medical College of Thomas Jefferson University, Philadelphia, PA, USA
• h James Buchanan Brady Urological Institute, Johns Hopkins School of Medicine, Baltimore, MD, USA
• i Glickman Urological & Kidney Institute, Cleveland Clinic, Cleveland, OH, USA
• j Department of Urology, Mayo Clinic, Rochester, MN, USA
• k Department of Pathology and Laboratory Medicine, Mayo Clinic, Rochester, MN, USA

European Urology, Volume 68 Issue 4, October 2015, Pages 555-567

Keywords: Prostate cancer, , Microarray, Prognosis

Автор перевода: Шатылко Тарас Валерьевич